A finalidade de um laboratório de pesquisa é produzir trabalhos de pesquisa e serviços com qualidade e eficiência, nos mais altos padrões, atendendo de forma consistente, os requisitos dos protocolos de cada experimento ou pesquisa. Para que estes ideais sejam alcançados, alguns passos devem ser seguidos, tais como: i) realizar experimentos de excelente qualidade assegurados pelo rigoroso cumprimento dos requisitos das boas práticas de laboratório, ii) possuir um quadro de funcionários envolvido, comprometido e motivado em todos os níveis do laboratório e iii) implementar, controlar e manter um Sistema da Qualidade baseado nos requisitos exigidos pela ANVISA, Ministério da Saúde e demais normas reguladoras específicas. A aplicação de Sistemas da Qualidade em atividades de pesquisa e desenvolvimento em instituições de pesquisa de um modo geral ainda é incipiente, mas durante os últimos anos tem havido um crescente interesse no desenvolvimento de uma estratégia para aplicação destes Sistemas. Uma vez que existe cada vez mais a necessidade de comprovar e assegurar a rastreabilidade dos resultados das pesquisas publicadas que possibilitam a sua repetição ou melhoria a qualquer tempo, este trabalho teve como objetivo avaliar o processo de implantação de um sistema de gestão da qualidade em um laboratório de pesquisa básica de uma instituição pública, avaliando sobretudo, a viabilidade e os impactos desta melhoria. Os resultados revelam que a implantação do Sistema de Qualidade BPL aplicado no Laboratório de Imunoparasitologia LIP da Fundação Oswaldo Cruz – Bahia é viável desde que para isso mudanças comportamentais e estruturais sejam feitas. Impactos positivos foram percebidos durante o processo, os quais foram relacionados com diversas melhorias.