A hanseníase é uma doença infecciosa crônica causada pelo Mycobacterium leprae, influenciada por fatores genéticos e ambientais. Essa infecção possui um vasto espectro clínico e imunológico, podendo causar aos pacientes altas taxas de morbidade, o que tem grande impacto na saúde pública. Esse trabalho tem como objetivos avaliar por meio de estudo caso-controle a associação dos genes PARK2 e PACRG com a hanseníase em uma população afetada do estado da Bahia e verificar se há diferenças no perfil de expressão desses genes entre indivíduos afetados com a hanseníase em relação a controles. Por meio da estratégia de genes candidatos, foram selecionados marcadores (SNPs) para os genes PARK2 e PACRG previamente associados com a hanseníase em populações do Brasil e Vietnã. Foram selecionados 338 indivíduos diagnosticados para hanseníase e 346 indivíduos sadios da área endêmica de leishmaniose tegumentar. A genotipagem dos marcadores foi realizada pelo método de PCR Snapshot® da Applied Biosystems. O estudo da expressão gênica foi realizado com TaqMan RT-PCR em 60 pacientes com hanseníase divididos em grupos de 20 indivíduos sem reação (hansen per se), 20 indivíduos com reação tipo I e 20 com reação tipo II. Além desses foram utilizados 20 controles saudáveis, doadores voluntários de sangue. Métodos de associação foram utilizados para analisar os dados. Para o estudo genético foi utilizado o teste de regressão logística incondicional (STATA v 9.0TM). Os estudos de expressão gênica foram analisados pelos testes de Mann Whitney e Kruskal-Wallis, utilizando o programa PRISMA. Os resultados confirmam uma associação entre os genes PARK2 (rs1801334 p<0,00001) e o gene co-regulado de PARK2, PACRG (rs1040079 p<0,0001, rs9356058 p=0,027 e rs6939278 p<0,00001) e o status hanseníase per se. A expressão ex vivo para os genes PARK2 e PACRG foi semelhante entre pacientes com hanseníase (hansen per se, e reações I e II) (p>0,05), entretanto menor nos pacientes em relação aos controles sadios avaliados (p=0,007). Como conclusões principais, foi confirmado o papel dos genes PARK2 e PACRG na patogênese da doença na população da Bahia. As análises mostram que pacientes tem menor expressão desses genes em relação aos controles.